高速冷凍離心機的轉速可達10000rpm~25000rpm之間，除具有低速冷凍離心機的性能和構造外，高速離心機所用角式轉頭均用鈦合金和鋁合金制成。離心管為耐高溫抗逆性強的高分子聚乙烯硬塑料制品。這類離心機多用于搜集微生物、細胞碎片、細胞內容物、大的細胞器、免疫細胞素沉淀物及無機沉淀物等。